くろたんく雑記帳

日常とか、わんちゃんとか、機械学習とか、競プロとか、

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技術

【M1】devcontainerを使った、研究コード開発環境の構築

はじめに 前提 M1という障壁 対応策 Dockerfile docker-compose.yml とりあえずテスト pythonモジュールの作成 モジュールを動かしてみる devcontainer devcontainer.json docker-compose.yml devcontainerの起動 Jupyter Notebookについて おわりに はじめ…

【M1】Dockerコマンド補完でハマったのでメモ

はじめに Dockerコマンドの補完機能の設定について おわりに はじめに Apple Silicon (M1)のMacBook ProでDocker Desktopを導入後Dockerコマンドを補完するやり方をこれまでのMacBook Proと同じようにはできなかったので、ドキュメントに書いてある方法など…

GraphQL-based APIによるPDBのデータ取得(Ligand 情報編)

はじめに GraphQL-based API 経緯 PDB IDからのLigand情報の取得 終わりに はじめに はじめて(PDB)https://www.rcsb.org/というタンパク質のDBを触ったが、GUIではなくAPIを利用したデータ取得に少し手間取ったのでメモ。参考は以下 今回は主に、GraphQLによ…